Namundemikian, kalo melihat ketiga putra beliau, yakni Kyai Abdullah, Kyai Anwar dan Kyai Abdul Mun'im yang menuntut ilmu ke Pondok Pesantren Sidoresmo Surabaya dan Pondok Pesantren Syaikhona Kholil Bangkalan Madura, maka dapat dipastikan bahwa Syekh Buyut Harun juga pada masa remajanya pernah melakukan pengembaraan tholabul Ilmi, selain
Jikadicermati dari aspek historis atau sejarah sesuai yang termaktub pada KH Kholil silsilah yaitu Muhammad Kholil atau KH Kholil Bangkalan Madura bernasab kepada para ulama. Bahkan sang ayah, KH Abdul Lathif masih memiliki hubungan darah degan kanjeng Sunan Gunung Jati. Ayah KH Abdul Lathif atau kakek dari Muhammad Kholil bernama Kyai Hamim. .